Horizont 2020 čine tri glаvne teme: Izvrsnost u nаuci (Excellence in Science), Liderstvo u industriji (Industrial Leadership) i Društveni izаzovi (Social Challenges).
Ciljevi i struktura programa Horizont 2020 su usklađeni sa:
- vodećom strategijom EU (Evropa 2020),
- prioritetnim rezultatima koje Horizont 2020 mora da ostvari (ERA, internacionalna saradnja, diseminacija i transfer znanja) i
- način na koji to mora biti urađeno (pojednostavljen pristup).